Collection(s) : Pratique R
Paru le 21/11/2014 | Broché XIX-240 pages
Master
Réseaux bayésiens avec R
Cet ouvrage introduit ses lecteurs à la découverte des réseaux bayésiens.
À partir d'exemples simples, mais suffisamment complexes pour détailler les différents mécanismes en cause, les trois premiers chapitres présentent les réseaux bayésiens pour variables discrètes, variables gaussiennes et variables quelconques. Toutes les étapes de construction, de vérification des propriétés, d'estimation et d'interprétation sont illustrées par l'usage de fonctions R. Le but est de permettre aux lecteurs de reproduire la démarche pour leurs propres problématiques, en utilisant leurs propres données par simple adaptation de ce qui est présenté.
Le quatrième chapitre propose un traitement concis mais rigoureux des théories mathématiques sous-jacentes couvrant la définition des réseaux bayésiens, les principaux algorithmes d'apprentissage de structure à partir de données et les requêtes d'exploration des propriétés d'un réseau estimé pour répondre à diverses questions concrètes.
Le cinquième chapitre est dédié à une revue des principaux logiciels disponibles, en particulier des paquets R existant. Le sixième chapitre est le traitement en détails de deux situations réelles qu'ont abordées les auteurs dans leurs activités professionnelles, à l'aide des réseaux bayésiens. Il comprend également les principales commandes de R utilisées pour mener les calculs.
Les cinq premiers chapitres comportent des exercices dont les solutions sont proposées en fin d'ouvrage. Deux annexes indépendantes sont consacrées à la théorie des graphes et aux distributions de probabilité majeures. Enfin, un glossaire des termes spécialisés employés tout au long de l'ouvrage est fourni ainsi qu'un index général, il contient en particulier les références de toutes les fonctions R invoquées.
Les auteurs ont cherché à d'abord expliquer les concepts par l'intuition et l'exemple avant d'aboutir au formalisme mathématico-informatique. À la fois pratique et théorique l'ouvrage sera utile aussi bien aux chercheurs et ingénieurs qui doivent modéliser une situation incertaine ou interpréter des données où interviennent de nombreuses variables aléatoires qu'aux étudiants en mathématiques appliquées.
Jean-Baptiste Denis est chercheur sénior au département de Mathématiques et Informatique Appliquées de l'INRA (Institut National de Recherche Agronomique). Ses outils préférés sont les approches bayésiennes (réseaux et aussi statistique) qu'il utilise en particulier pour la modélisation des risques microbiologiques liés à l'alimentation. Il est l'auteur du paquet R, rbmn, consacré à la manipulation des réseaux bayésiens gaussiens.
Marco Scutari, après avoir été chercheur associé en génétique statistique à l'Institut de Génétique de l'UCL (University College London), débute une charge d'enseignement au département de statistique de l'université d'Oxford. Son thème de recherche de prédilection est la théorie des réseaux bayésiens et leur application aux données biologiques. Il est l'auteur du paquet R le plus complet sur les réseaux bayésiens, bnlearn, consacré en autres à l'apprentissage.
